Metal Gear Solid V: Phantom Pain on nyt virallisesti oikea suurjulkaisu, sillä peli kärsii julkaisussaan verkko-ongelmista. Peli kärsii ongelmista kaikilla viidellä tuetulla alustalla ja Konami on ilmoittanut toimivansa ongelmien parissa ja pyrkivänsä saamaan serverit täyteen toimintaan. Uutisen kirjoitushetkellä pelin tukisivulla jokaisen alustan ilmoitetaan olevan huollon kohteena.
Englannin lisäksi tukisivulla ilmoitetaan palvelinten kunnosta, mutta sivun japanilaisesta osiosta löytyy hieman lisätietoa. Karkeasti kännettynä punaisella lisätekstillä ilmoitetaan Xbox-alustojen kärsivän erityisen hankalista ongelmista, joiden korjaamisessa tulee kestämään useita päiviä.
Pelaajat ovat kärsineet verkko-ongelmista varsinkin Xbox Onen puolella ja joidenkin tapauksissa pelin online-ominaisuuksiin ei ole päästy kiinni missään vaiheessa.